对于粉剂包装机的使用者来说，尤其是大型企业的大型规模生产情况来讲，设备的日常清洁和消毒是必要的，而对粉剂包装机而言，在换品种、换批号、生产前后、维修后、出现质量问题时都是必要清洁和消毒的时刻，一般采用洗涤剂作为清洁剂，75%乙醇溶液、3%双氧水的消毒剂，具体的清洁方法和消毒方法如下：
清洁方法：
1、拆下下料筒、成型槽、下料器移至清洗间用饮用水洗净后再用纯化水冲洗一遍。
2、用抹布把设备内外擦洗干净，很后用蘸有纯化水的抹布擦洗一遍。
3、用铜丝刷刷掉热封轮上面的粘附物，用蘸有纯化水的抹布擦洗干净。
消毒方法：
1、每天生产结束清洁后，对设备直接接触药物的部位，用抹布蘸取75%乙醇或3%双氧水擦抹两遍。
2、清洁消毒后填写设备清洁、消毒记录，QA检查员监督检查，检查合格，贴挂“已清洁”标示卡。
3、清洗效果评价：用白色干净抹布检查，设备内外无污迹。
4、清洁工具清洗及存放：按《清洁工具清洁标准操作规程》执行。